关于高通量筛选方面 ,用什么仪器比较好一些嘛?如何高通量研究细胞转化的分子机制
1、关于高通量筛选方面 ,用什么仪器比较好1些嘛?
那你可以选择赛多利斯的仪器,他们在这方面很权威,从细胞结构,表型分析,分化发育,活细胞成像,到药物筛选,动物模型等1台仪器全搞定,个人感觉挺好。
2、如何高通量研究细胞转化的分子机制
1.来自中国科学院,浙江自然博物馆,英国莱斯特大学等处的研究人员发现了1个成年达尔文翼龙(Darwinopterus)的化石以及1枚与其在1起的蛋,并对这种恐龙进行了雌雄两性比较,从而为判别这些已灭绝动物的性别提供了直接证据。这1研究成果公布在上周出版的Science杂志上。
2. 来自哈佛医学院,麻省总医院,澳大利亚墨尔本大学等处的研究人员就利用这1技术进行了大规模测序,并配合功能预测,和实验验证,揭示了线粒体complex I失序症的分子机制,从而提出了1种利用高通量测序方法分析候选基因的新策略。这1研究成果公布在Nature Genetics杂志上。
3.近期来自中国、美国和韩国的科学家在miRNA研究领域又取得1些重要的研究进展,研究成果相继发表在国际顶级期刊Nature 和Cell杂志上,值得关注。
4.近日上海交通大学生命科学技术学院力学生物学与医学工程研究所在国家自然科学基金重点项目“血管细胞分化与迁移的力学生物学机制”研究取得重要进展,研究论文发表在本年1月18日的《美国科学院院刊》(PNAS)上
5. 近日中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所肖磊课题组利用病毒载体在细胞中表达多种重编程因子,诱导绵羊成纤维细胞重编程转化成诱导多能干(iPS)细胞,这是目前世界上首次报道获得的绵羊iPS细胞系。研究论文在线发表在2011年1月11日的《细胞研究》(cell research)杂志上。
3、荧光显微成像系统evos工作原理?
全新的Invitrogen™ EVOS™ FL Auto 2成像系统将高性能和快速自动化成像带到您的实验室。该系统提供了先进的性能,使严苛要求的细胞成像应用变得简单,如活细胞成像、图像拼接和Z-stack成像,因此研究人员可以关注数据本身,而不是仪器操作。快速—96孔板3荧光通道整板扫描,只需不到5分钟灵活—提供20多种用户可更换的LED光立方、1.25X至100X的各种物镜和多种容器适配器,可根据实验自定义系统延时活细胞成像—含氧或缺氧状态下精确的温度、湿度和气体控制,利用载物台式培养箱,可在生理学条件下实现各种生物学应用研究视野—可在低倍镜单视野和高倍镜扫描模式之间快速、无缝切换,轻松定义并采集目的区域自动化—节省时间 (如自动聚焦、快速机械载物台和自动化常规操作) 可缩短实验时间,实现高通量、高数据质量和更佳的实验可重复性数据分析—可选的高级软件包,实现定量和统计学分析荧光功能多样性。
4、不用微流控,怎样提高高通量测序单细胞基因组的成功率
Tn5是1种转座酶,可以将DNA片段插入到基因组中,因此可以利用Tn5,将想要的序列插入到基因组,并且可以将基因组打断成相应的片段,并且在末端链接上想要的序列,如果我们在末端链接的序列上,使用不同的序列,因此便可以进行复杂的组合建库。
那什么叫复杂建库那?
复杂建库的方法就是将PCR index引入的时候,和Tn5 index引入的时候,进行组合,从而最终可以形成数十万种不同的index,而每1个细胞将会得到唯1的index,这也就是复杂建库的精髓所在。
那么如何将复杂建库应用在单细胞测序上哪?
其实两年前,便有科学家们着手这方面的研究,通讯作者Jay也就是本期单细胞HiC的通讯作者。
上图也就是复杂建库方法的精髓所在,首先将细胞用FACS分选到96孔板中,让每个孔有25个左右的细胞,然后不同孔之间使用不同的Tn5对应的index,进行插入整合。这个时候,每个孔内细胞的index是1样的,而且细胞是完整的。
然后再对细胞进行混合和重新分配,然后这样,在新的96孔板里面,每个细胞的index是不1样的,然后对每1个孔,裂解,加上PCR对应的index,这样就保证了每个细胞的index的唯1性。
理解了这种index的复杂建库方法进行单细胞测序后,Jay在2014年这篇Science中开展的就是ATAC-seq,事实上,转座酶对染色体的插入并非均1的,而是插入在活性区域,这样便可以进行活性区域的判断。
然而,如果是想要单细胞DNA测序的话,这个便成了劣势,显然,如果有些区域无法插入,进而就无法建库,那么无法进行DNA覆盖。
因此科学家们构思了1个非常巧妙的方法,第1种方案是通过锂辅助的核小体去除的方法,第2种是通过SDS然后欧联的方法。
通过这两种方法,可以看到在上图中,仍然保持细胞核的完整性。
然后用复杂建库的方法,进行测序,这个时候就可以获得更加平均插入的Tn5,index。
从这张图可以看到与标准的进行比对,LAND和xSDS两种方法,可以具有更加均衡的插入建库。
既然获得了这种方法,下面需要做的便是评价方法的适用情况,是否可以进行有效的基因组建库?与其他方法相比如何?
首先科学家们对测序的序列,进行分析,可以看到所有的细胞中,明显的分为两类,1类是具有重复序列很少,质量比较高,1类重复序列很多。显然前者更适合用于最终的数据分析。
那么是否真的是单细胞分析那?
科学家们将小鼠和人的细胞进行混合,这样,如果最终测到的细胞有小鼠和人细胞混合的reads,那么提示并非真正的单细胞。不过这1类数据很少,提示确实是单细胞数据。
那么测序数据的覆盖度如何那?
MAD和MAPD可以用于评价不同测序方法覆盖度的水平,分数越低越好,可以看到在两种评价标准中LAND都比xSDS差。
SCI-seq最显著的应用便是用于基因组拷贝数情况的分析:
首先针对于不同核型的细胞,科学家们对不同的方法进行分析:
可以看到过滤后的数据而言,xSDS已经和DOP和QRP相差无几。
最终科学家们将这种方法,应用于恒河猴的大脑染色体拷贝数分析,和癌症单细胞拷贝数分析:
可以预见在不远的将来单细胞测序的费用越来越低,将成为人们解析更高层次的生命活动的基本手段。
5、高通量流式细胞仪推荐那款可以选?
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6、做高通量基因测序筛查多少钱?
主要看你筛查的范围和多少,1般都要以前多以上,筛查得越多,越贵,如果是做全外显子的话就要56千,全基因组要上万,都不1样收费,你可以具体去咨询1下检验公司,比如华银。