基因表达谱芯片,准备做猪的全基因组SNP 方法是基因芯片来做，但是不知道现在猪的芯片是需要自己设计还是买得到现成的。

1、基因表达谱芯片

下1步可以先进行基因差异表达的分析，获得差异表达基因，再选择其中自己所要研究的基因进行下游分析。软件有很多，推荐1个开放源的语言:R 语言和bioconductor。

2、准备做猪的全基因组SNP 方法是基因芯片来做，但是不知道现在猪的芯片是需要自己设计还是买得到现成的。

猪的全基因组序列应该已经有了,如果做SNP,可以用基因芯片做,自己设计1个芯片,让Affymetrix生产就可以了. 如果做表达谱,直接购买Affymetrix的表达谱芯片就可以了,可以买了芯片自己做,也可以找服务商做.Affymetrix有猪表达谱芯片产品.。

3、想要研究肾病外周血淋巴细胞免疫相关基因的表达变化，用Affymetrix人类全基因组表达谱芯片，结果容不容易

探针标记试剂盒和芯片是1套 我从上海走的5K左右 包括结果分析 你只要用子探头装好分离出的淋巴细胞样本固定以后放在干冰箱里快递到公司就可以了 如果自己买1整套试剂盒操作不好不容易出结果 公司人带你全套做好以后还有数据分析 很容易发文 另外杂交位点的干扰时经过计算撇除的 不用担心。

4、我该选择表达谱基因芯片还是功能分类基因芯片？

为什么不考虑高通量测序做基因表达谱分析呢？高通量测序技术研究表达谱具有高敏感的特性，可以捕捉到很多低表达的基因。 1.数字化信号：直接测定每个基因的特异性表达标签序列，通过计数表达标签序列的数目来确定该基因的表达量，大大提高了定量分析的准确度。整体表达差异分布符合正态分布，不会因为不同批次实验引起不必要的误差； 可重复性高：不同批次的表达谱度量准确，能够更准确的进行表达差异分析； 3. 高灵敏度：对于表达存在差异的基因能够灵敏的检测其表达差异；能够检测出低丰度的表达基因； 4. 全基因组分析：由于该技术不用事先设计探针，而是直接测序的方式，因此无需了解物种基因信息，可以直接对任何物种进行包括未知基因在内的全基因组表达谱分析； 5. 高通量测序：已有数据表明，当测序通量达到200万个表达标签时，即可得到样本中接近全部表达基因的表达量数据，而目前每个样本分析可以得到300 万~600万个表达标签； 6. 无需重复实验； 7. 可同时发现新的转录本、基因组表达调控区域等； 8. 高性价比，完整深入的生物信息学分析支持。 该方法已经应用于各个物种的不同组织、器官等差异表达基因的研究及功能基因组研究等领域。近来又被广泛应用于包括各种疾病在内的临床医学研究等领域。 你可以咨询专业的高通量测序公司或者研究所，比如：北京基因组所、军事医学科学院，或者北京新基永康基因科技有限公司。他们都有这方面的经验。

5、什么是转录表达谱

应该就是基因表达谱。翻译表达谱的话，就是蛋白表达谱 表达谱差异分析(differential expression profiling)主要包括基因表达谱(gene expression profiling) 和蛋白质表达谱(protein expression profiling) 。大规模表达谱分析已经成为认识疾病分子机制的有利方法,在癌症研究等方面取得了1定的进展。成功的表达谱分析基于实验及其过程分析的有机结合。实验过程从关注的疾病开始,首先收集大量的疾病相关组织样本,样本数量可从10 多个到数百个,但必须足以对每1组织类型及个体差异进行比较分析,而且许多情况下不能仅简单地分为正常和疾病组织。例如,在对糖尿病的研究中,所收集的样本来自健康人、胰岛素耐受和糖尿病病人的不同试验阶段,如胰岛素治疗前后。样品还应包括其他器官的取材,以便进行基因表达的组织分布研究。为了便于对后来的实验数据进行分析管理,需采集并储存所有的组织样本和临床参数。接下来进行组织样本的处理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cDNA 芯片或全基因组芯片) 进行表达谱测定,并进行生物信息学分析。 通常,表达谱的分析结果需进1步的实验加以证实。定量RT2PCR 是最灵敏的确证方法,该方法还可以将确证实验的范围扩大到原测组织以外的更广泛的组织和组织类型,揭示基因表达的组织分布情况。 确证实验揭示了疾病相关基因。据此,可以进行进1步研究,探索这些基因的功能,开发新的治疗手段。例如,对于正常和疾病组织中表达有显著性变化的基因,可以进行新治疗靶点的鉴定和确定研究,或利用实验和分析工具研究分析其功能;对于疾病组织中活性升高的酶,可以当作前药活化酶进行鉴定研究。典型的表达谱能够显示疾病过程中有大量的已知基因表达的改变,而许多已知基因的代谢通路、表达产物酶学分类和蛋白质功能业已发表,将两者对照分析,可以鉴定出酶活性,选择其中可能成为前药活化酶的部分进行进1步研究;对于疾病特异的蛋白质,可以进行抗原表型分析,决定疫苗的开发策略。 寻找差异表达基因的方法除芯片技术外,1些新的检测方法如差异显示PCR ( differential display PCR, DD－PCR) 、消减杂交( suppression subreactive hy bridization , SSH) 等也相继得到结合应用。

6、请教下高手，生物芯片，基因芯片和表达谱芯片有怎样的1个关系？

广义的生物芯片指1切采用生物技术制备或应用于生物技术的微处理器。狭义的生物芯片就是指基因芯片。基因芯片是固定有寡核苷酸、基因组DNA或互补DNA等的生物芯片。利用这类芯片与标记的生物样品进行杂交，可对样品的基因表达谱生物信息进行快速定性和定量分析。 表达芯片的具体定义我没有找到，简单地说是用来表达蛋白质。所谓芯片，实际就是个载体，上面载有要研究的对象，最大的优点就是高通量，也就是可快速操作的剂量大。